Herramienta web para la clasificación de microsatélites polimórficos en genomas bacterianos / Web Tool for classfication of polymorphic microsatellites in bacteria genomes

Las secuencias repetidas en tándem, específicamente los mini y micro satélites, han demostrado ser muy eficaces en la clasificación de bacterias patogénicas como B. anthracis, M. tuberculosis y P. aeruginosa, entre otras. En humanos es manifiesta su participación estando relacionados con más de ochenta enfermedades, gran parte de ellas de tipo neurodegenerativas, musculares y algunos tipos de cáncer. La herramienta web que presentamos es el resultado de la detección computacional de estas secuencias en genomas bacterianos completos y su correspondiente anotación en la estructura genómica de acuerdo a las diferentes regiones donde estos se localizan. La herramienta tiene como fin primario brindar un sistema relacional que permita al investigador ubicar los microsatélites de diferentes especies bacterianas, con más de un genoma secuenciado para inferir su posible carácter polimórfico, dentro del contexto de la estructura genómica y así proveer un primer acercamiento al rol putativo que los microsatélites desempeñan desde el punto de vista funcional. La herramienta se puede aplicar no solo en estudios taxonómicos y epidemiológicos sino en la detección de posibles relaciones de estas secuencias con las funciones moleculares, procesos biológicos y, en última instancia, las diversas formas de evolución de estas especies. El sitio web brinda el servicio de consultas a la base de datos de microsatélites bacterianos de acuerdo al sistema de tablas relacionales y atributos propios de las mismas. Cuenta además con los servicios típicos de un sitio con estas características como: sistema de autenticación, foro, encuestas, enlaces y documentación sobre la metodología empleada y del tema en cuestión(AU)

The tandem repeat sequences, especially mini and microsatellites, have proven to be very effective in classification of pathogenic bacteria such as B. anthracis, M. tuberculosis and P. aeruginosa, among others. In human beings it is manifest its participation, being related with over eighty diseases, nearly all neurodegenerative and muscular, and some kinds of cancer. The web tool we are offering here is the result of computational detection of these sequences in whole bacteria genomes, and its respective annotation in the genomic structure according to the different regions where they are localized. The primary goal of this tool is to offer a relational system that allows mapping the microsatellites of bacterial species, all of them with more than one genome sequenced to infer their possible polymorphic character, in the context of genomic structure and thus providing a first approach to the putative role they perform from the functional point of view. The tool can be applied not only in taxonomical and epidemiological studies but in the detection of possible relationships of these sequences with the molecular functions, the biological processes and, as a last resort, the different forms of these species evolution. The web site offers the service of queries to the bacterial microsatellites database according to the related tables and its inherent attributes. It also has the typical services of this kind of site like: logging system, forum, polls, links and documentation about the employed methodology and the topic(AU)

Tecleo e inducción visual del bostezo en pacientes ansiosos: La Lisa, Ciudad de La Habana, 2008-2009 / Tapping and yawning visual induction in anxious patients: La Lisa, Ciudad de La Habana, 2008-2009

Debido a la vida tan dinámica de hoy día, y a factores de índole ambiental, genético y social, la ansiedad ha pasado a ocupar uno de los lugares principales dentro de los trastornos psicológicos, no solo en Cuba, sino a nivel mundial. Actualmente el diagnóstico y su evaluación se basan en pruebas subjetivas fundamentalmente a través de test. Motivados por los elementos antes expuestos se decidió investigar con el objetivo de hacer una evaluación preliminar de un software encaminado a medir variables, mediante la prueba del tecleo (mouse finger tapping) e inducción del bostezo, que aporten elementos objetivos para la valoración de pacientes con trastornos de ansiedad. Se realizó un estudio descriptivo transversal sobre la observación de las pruebas realizadas en pacientes atendidos en el Centro Comunitario de Salud Mental La Lisa, Ciudad Habana, de enero de 2008 a septiembre de 2009. La población de estudio estuvo conformada por 90 sujetos, y fueron evaluados mediante la prueba de Scam. Se tomaron datos de la historia clínica individual, y posteriormente se procesaron y representaron en tablas arribando a resultados. Se concluyó que las pruebas de tecleo e inducción visual del bostezo, permiten diferenciar de manera eficiente los grupos de sujetos estudiados.

Due to the agitated dynamic of the current life and many other environmental, genetic and social factors, the anxiety has passed to occupy one of the main places among the psychological dysfunctions, not only in Cuba, but at the world level. Nowadays the diagnosis and evaluation of this illness are based fundamentally on subjective tests. Motivated by the previously exposed elements, we decided to carry out a research with the objective of preliminary evaluating a software made for measuring variables, by means of the tapping test (mouse finger tapping) and yawn induction that renders objective elements in the evaluation of patients with anxiety dysfunctions. We carried out a cross-sectional descriptive study on the observation of the tests made in patients attended at the Communitarian Center of Mental Health La Lisa, Ciudad de La Habana, from january 2007 to september 2008. The studied population was formed by 90 subjects that were evaluated by means of the Scam test. We collected data from the individual clinical history. They were processed and shown in tables and charts arriving to conclusions. We concluded that the tapping test and the test of yawning visual induction allow differentiating, in an efficient way, the groups of studied patients.

Aplicación de la prueba de tecleo en la enfermedad de Parkinson / Application of typing test in Parkinson's disease

Se realizaron pruebas diagnósticas como la prueba de tecleo reiterado en un intervalo de tiempo de 1 min, para corroborar la presencia de alteraciones en la vía dopaminérgica. Cuando esta se realiza en una computadora convencional pueden presentarse errores como el sobrerregistro que alteraría sus resultados. Es por ello que se propuso un programa computacional que garantizara la ejecución correcta y el procesamiento adecuado de los resultados. Para comprobar la capacidad diagnóstica de este programa se hizo la prueba a 30 sujetos sanos y 30 pacientes parkinsonianos sin medicación y después de administrarle levodopa. Se corroboró que la respuesta motora en la prueba de tecleo resultó significativamente menor en los pacientes parkinsonianos respecto a los controles, en ambas manos, y después de la administración de levodopa a los pacientes aumentó la velocidad de cambio en las etapas de la prueba de tecleo. Se consideró que la prueba de tecleo permite una valoración objetiva de la funcionalidad de la vía dopaminérgica en los pacientes con Parkinson.

Diagnostic tests as the reiterated typing test at time intervals of 1 minute were made to corroborate the presence of alterations in the dopamine via. When this test is made in a conventional computer, there may be errors as the overregister that would alter its results. That's why, a computer program was proposed to guarantee the correct execution and the adequate processing of the results. To demonstrate the diagnostic capacity of of this program, 30 sound subjects and 30 parkinsonian patients without medication and after the administration of levodopa had the test. It was confirmed that the motor response in the typing test was significantly lower in parkinsonian patients compared with controls, in both hands, and that after administering levodopa to the patients, the change speed in the stages of the typing test increased. It was considered that the typing test allows an objective assessment of the functionality of the dopamine via in patients with Parkinson's disease.